進化経済学会では，毎年秋と春に全体での会議を開催しています。
毎年，9月か10月に開催されるオータムコンファレンスでは，内外からゲストスピーカーを招聘し，進化経済学とその周辺領域の最先端の研究の講演とパネルディスカッションをおこなっています。
また，毎年3月の最終土，日に開催される全国大会では，40～100の報告が10～20のセッションにわかれて行われます。また会長講演や統一テーマに沿ったパネルディスカッションがおこなわれ，海外からのゲストスピーカも加えて活発な議論が交わされます。
本大会では，ポスターセッションも開催されています。若い研究者にとって気軽に参加できて，研究のアドバイスをもらいやすい非常に効果的な方法です。また，ポスターセッションは学会員以外の人々にも開かれています。大会本部に申し込んでいただいて，本部で審査をパスしたものであればどなたでも報告していただけます。ポスターセッションは，これから進化経済学を始めようと考えている方や進化経済学者とのコラボレーションを模索している方にとってもまたとない機会を提供しています。
加えて，2022度第27回大会から，オータムコンファレンスの一環としてライブ・プレゼン・フェス（LPF）が開催されるようになりました。ライブ・プレゼン・フェスはアイデア段階の研究を，理事・フェローも含め，励まし育てていくイベントです。中堅・若手の自由な発想，シニアの新たな挑戦に期待します。進化経済学会員や近い将来進化経済学会へ入会する可能性があるすべての人で、着想段階や未発表段階で議論し，ブラッシュアップしたい人ならば誰でも報告可能です。
ともすれば自分の領域に閉じこもってしまいがちな研究者にとって，他の領域の研究を知ることはインスピレーションを得るという点においても大きな効果があります。若い大学院生や若いころに戻ってどんどん議論しようと考えている熟練の研究者の交流の場を提供しています。
過去の開催履歴
2023年度 第28回大会
会場：福井県立大学
大会テーマ：「空間の進化経済学とその可能性」
オータムコンファレンス：2023年9月16日（土）
年次大会：2024年3月16日（土）-17日（日）
webサイト：https://jafee.org/2023fukui/
2022年度 第27回大会
会場：立教大学
大会テーマ：「AI（人工知能）と経済社会の未来」
オータムコンファレンス：2022年9月17日（土）
年次大会：2023年3月18日-19日
webサイト：https://sites.google.com/rikkyo.ac.jp/jafee2022
2021年度 第26回大会
会場：同志社大学（covid-19感染拡大のためweb開催）
大会テーマ：「混迷の世界と経済学」
オータムコンファレンス：2021年9月11日(土)
年次大会 2021年3月25日−27日
webサイト：https://jafee2021kyoto.wixsite.com/evoeco
2020年度 第25回大会
会場：静岡大学（covid-19感染拡大のためweb開催）
大会テーマ：「現代資本主義の変容と地域の制度設計」
オータムコンファレンス：2020年9月19日(土)
年次大会 2021年3月27日−28日
webサイト：https://jafee2020shizuoka.wixsite.com/evoeco/program
2019年度 第24回大会
会場：東北大学（covid-19感染拡大のためweb開催）
大会テーマ：「デジタル化がもたらす資本主義社会の進化」
オータムコンファレンス：2019年9月12日（木）（岐阜県飛騨高山市）
年次大会 2020年5月23日−24日（covid-19感染拡大のため延期開催：web開催）
webサイト：https://jafee2019sendai.wixsite.com/evoeco/program
2018年度 第23回大会
会場・名古屋工業大学
大会テーマ：「技術・産業の進化と資本主義のゆくえ」
オータムコンファレンス：2018年9月29日（土）
年次大会 2019年3月16日−17日
webサイト：https://jafee2018nagoya.wixsite.com/evoeco
2017年度 第22回大会
会場：九州大学
大会テーマ：「選好、制度、経済システムの進化」
オータムコンファレンス 2017年9月25日
年次大会 2018年3月29日−30日
webサイト：https://sites.google.com/view/jafee-kyushu-2017
2016年度 第21回大会
会場：京都大学
オータムコンファレンス 2016年9月24日
テーマ：進化経済学のあゆみと展望 －進化経済学を問う
年次大会 2017年3月24日−25日
テーマ：自然科学と社会科学の融合
2015年度 第20回大会
会場：東京大学
大会テーマ：「社会・経済システムにおけるICTとネットワーク」
オータムコンファレンス 2015年9月20日
年次大会 2016年3月26日−27日
webサイト：http://jafee.sakura.ne.jp/tokyo2015/tokyo2015.html
同時開催：International Conference on Socio-economic Systems with ICT and Networks
webサイト：http://jafee.sakura.ne.jp/tokyo2015/ic.html
2014年度 第19回大会
会場：小樽商科大学
大会テーマ：「退行的進化を考える」
オータムコンファレンス 2014年9月20日
年次大会 2015年3月21日−22日
2013年度 第18回大会
会場：金沢大学
webサイト：https://sites.google.com/site/evoecokanazawa/
2012年度 第17回大会
会場：中央大学
2011年度 第16回大会
会場：摂南大学
webサイト：http://jafeeosaka.web.fc2.com/
2010年度 第15回大会
会場 名古屋大学
2009年度 第14回大会
会場：四天王寺大学
2008年度 第13回大会
会場 岡山大学
2007年度 第12回大会
会場：鹿児島国際大学
webサイト：http://www.iuk.ac.jp/~evoeco/
2006年度 第11回大会
会場：京都大学
2005年度 第10回大会
会場：北海道大学
webサイト：http://cc.fm.senshu-u.ac.jp/evoeco_10thconf
2004年度 第９回大会
会場：東京工業大学
2003年度 第８回大会
会場：福井県立大学
webサイト：https://www.s.fpu.ac.jp/hattori/evolution.htm
2002年度 第７回大会
会場：専修大学
2001年度 第６回大会
会場：関西大学
2000年度 第５回大会
会場：九州産業大学
1999年度 第４回大会
会場：中央大学
1998年度 第３回大会
会場：大阪市立大学
1997年度 第２回大会
会場：東京大学
1996年度 第１回設立大会
会場：京都大学